Junto al mes de septiembre regresa el comienzo del curso académico y Eusko Ikaskuntza ha estado presente en los actos de apertura de cada universidad.
El 9 de septiembre, la Universidad Pública de Navarra (UPNA) celebro el acto de apertura del curso 2016-2017 con la participación de Iñaki Dorronsoro, Presidente de Eusko Ikaskuntza, y la presencia, entre otros, del rector Alfonso Carlosena y Uxue Barkos, presidenta del Gobierno de Navarra. El 12 de ese mismo mes, llegó el turno de UPV/EHU, con un acto celebrado en Bilbao. El día 14, Mondragon Unibertsitatea contó con la asistencia del presidente de Eusko Ikaskuntza y de su Director General, Iñaki Ibarra, en un acto celebrado en el Basque Culinary Center de Donostia. Al día siguiente, 15 de septiembre, la Universidad de Deusto realizo su acto de apertura contando con la representación de Rosa Miren Pagola, Vicepresidenta por Bizkaia de Eusko Ikaskuntza. Finalmente, el 16, la Universidad de Navarra celebró en sus propias instalaciones el acto al que acudió el presidente Iñaki Dorronsoro portando el nombre de Eusko Ikaskuntza.
