El año 1995 se puso en marcha la organización de los fondos de archivo de Eusko Ikaskuntza-Sociedad de Estudios Vascos. Las actuaciones realizadas hasta el momento han posibilitado la ordenación del archivo según el cuadro de clasificación creado para tal efecto.
Durante el año 2011 se catalogó la serie correspondencia de los años 1918 a 1922 inclusive (2.642 registros) con cargo a las ayudas de Eusko Jaurlaritza para organización de archivos privados y durante el año 2012 se ha digitalizado dicha correspondencia.
La segunda fase de catalogación del archivo histórico, financiada por Diputación Foral de Gipuzkoa, ha tenido como objeto la correspondencia entre los años 1923 y 1936 (8.347 registros) y las Secciones de Trabajo (3.907 registros).
El objetivo es continuar el plan de actuación para la sección 1 del Archivo Histórico de Eusko Ikaskuntza (1918-1936) y la correspondiente al Archivo Documental.
